Structural and energy determinants in protein-RNA docking
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Identification of RNA-binding sites in artemin based on docking energy landscapes and molecular dynamics simulation
There are questions concerning the functions of artemin, an abundant stress protein found in Artemiaduring embryo development. It has been reported that artemin binds RNA at high temperatures in vitro, suggesting an RNA protective role. In this study, we investigated the possibility of the presence of RNA-bindingsites and their structural properties in artemin, using docking energy ...
متن کاملeconomic optimization and energy consumption in tray dryers
دراین پروژه به بررسی مدل سازی خشک کردن مواد غذایی با استفاده از هوای خشک در خشک کن آزمایشگاهی نوع سینی دار پرداخته شده است. برای آنالیز انتقال رطوبت در طی خشک شدن به طریق جابجایی، یک مدل لایه نازک برای انتقال رطوبت، مبتنی بر معادله نفوذ فیک در نظر گفته شده است که شامل انتقال همزمان جرم و انرژی بین فاز جامد و گاز می باشد. پروفایل دما و رطوبت برای سه نوع ماده غذایی شامل سیب زمینی، سیب و موز در طی...
15 صفحه اولEnsemble docking of multiple protein structures: considering protein structural variations in molecular docking.
One approach to incorporate protein flexibility in molecular docking is the use of an ensemble consisting of multiple protein structures. Sequentially docking each ligand into a large number of protein structures is computationally too expensive to allow large-scale database screening. It is challenging to achieve a good balance between docking accuracy and computational efficiency. In this wor...
متن کاملsupply and demand security of energy in central asia and the caucasus
امنیت انرژی به معنی عرضه مداوم و پایدار همراه با قیمت های معقول در حامل های انرژی، که تهدیدات امنیتی، سیاسی، اقتصادی، محیط زیستی و روانی را کاهش دهد. امروزه نفت و گاز تنها، کالای تجاری نیست بلکه بعنوان ابزار سیاسی مورد استفاده قرار می گیرد.اختلاف میان روسیه و اکراین بر سر انرژی در ژانویه 2006، تهدیدی برای امنیت انرژی اروپا ایجاد کرد. در این تحقیق ما تلاش کردیم که نقش انرژی آسیای میانه و قفقاز ر...
15 صفحه اولStructural Prediction of Protein-RNA Interaction by Computational Docking with Propensity-Based Statistical Potentials
Despite the importance of protein-RNA interactions in the cellular context, the number of available protein-RNA complex structures is still much lower than those of other biomolecules. As a consequence, few computational studies have been addressed towards protein-RNA complexes, and to our knowledge, no systematic benchmarking of protein-RNA docking has been reported. In this study we have extr...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Methods
سال: 2017
ISSN: 1046-2023
DOI: 10.1016/j.ymeth.2016.11.001